พิพิธภัณฑ์อุทยานธรณีสตูลจัดตั้งขึ้นเพื่อเป็นแหล่งประชาสัมพันธ์และให้ข้อมูลทางวิชาการ ส่งเสริมการเรียนรู้ทางด้านวิทยาศาสตร์ ส่งเสริมการมีส่วนร่วมของเยาวชน และสร้างความตระหนักของคนในท้องถิ่นในการหาแนวทางการอนุรักษ์แหล่งทรัพยากรธรณีของจังหวัดสตูล ลักษณะเป็นอาคารเปิดโล่ง ภายในจัดแสดงวัตถุไว้บนโต๊ะและตามฝาผนัง พร้อมทั้งติดป้ายอธิบายทุกชิ้น แบ่งการจัดแสดงออกเป็นส่วน ได้แก่ ส่วนจัดแสดงซากดึกดำบรรพ์สตูล ส่วนจัดแสดงแหล่งอนุรักษ์ทางธรณีวิทยาสตูล ส่วนจัดแสดงแบบจำลองลักษณะทางภูมิประเทศ ส่วนจัดแสดงข้อมูลอุทย