พิพิธภัณฑ์เภสัชกรรมไทย จัดตั้งขึ้นเพื่อให้ชนรุ่นหลังได้รู้ประวัติการแพทย์แผนไทยจนถึงปัจจุบัน จัดแสดงเรื่องราวตามหัวข้อต่างๆ ได้แก่ ต้นกำเนิดวิชาชีพเภสัชกรรม วิวัฒนาการเภสัชกรรมแผนตะวันออกและภูมิปัญญาพื้นบ้าน วิวัฒนาการเภสัชกรรมไทยแผนตะวันตก วิวัฒนาการสมุนไพรและผลิตภัณฑ์ธรรมชาติ ประวัติการศึกษาเภสัชศาสตร์ในประเทศไทย วิวัฒนาการวิชาชีพและบทบาทของเภสัชกร รวมถึงกำเนิดและบทบาทของเภสัชกรรมสมาคมแห่งประเทศไทยในพระบรมราชูปถัมภ์ อีกทั้งยังรวบรวมเภสัชภัณฑ์ในยุคต่างๆ คัมภีร์ สูตรยาโบราณ ตำรานวด ที่บันทึกในสม