พิพิธภัณฑ์เมืองหาดใหญ่ มหาวิทยาลัยหาดใหญ่ เป็นอาคารเรือนไทยแบบผสมผสานประยุกต์ มีลักษณะอาคารเรือนหมู่ ประกอบด้วยอาคารรวม 5 หลัง ซึ่งแต่ละหลังจัดวางเป็นอิสระแยกจากกัน แต่มีความสัมพันธ์เชื่อมโยงถึงกันตามแบบอย่างลักษณะเรือนไทยในสมัยโบราณ โดยมีแนวคิดการออกแบบ จากการผสมผสานระหว่างรูปลักษณ์ของอาคารกุฏิจาก “วัดท้ายยอ” จังหวัดสงขลา ซึ่งเป็นเรือนหมู่ที่สวยที่สุดแห่งหนึ่งในภาคใต้ ผสมผสานกับรูปลักษณ์ของอาคาร “มัสยิดวาดิลฮูเซ็น” หรือ “มัสยิดตะโละมาเนาะ จังหวัดนราธิวาส ที่มีอายุกว่า 300 ปี และมีเอกลักษณ์โดดเด่นพิเศษ พิพิธภัณฑ์เมืองหาดใหญ่ ชั้นล่าง จัดแสดงประวัติความเป็นมาและเรื่องราวเกี่ยวกับเมืองหาดใหญ่เป็นหลัก นอกจากนี้ยังมีข้อมูลสำคัญๆ ที่เกี่ยวกับจังหวัดสงขลาและภาคใต้ผนวกรวมเอาไว้ด้วย เช่น ประมวลภาพในหลวงรัชกาลที่ 9 เสด็จเยี่ยมเยียนราษฎรใน 14 จังหวัดภาคใต้ จัดแสดงโบราณวัตถุ ศิลปวัตถุ อาทิ เครื่องประทีป ศาสตราวุธ ภาชนะดินเผายุคสมัยต่างๆ นิทรรศการภาพถ่ายเก่าเมืองหาดใหญ่ ประวัติบุคคลสำคัญผู้บุกเบิกและพัฒนาเมืองหาดใหญ่ แผนที่โบราณภาคใต้ ส่วนจัดแสดงเรื่องราวทางด้านศิลปวัฒนธรรมของอำเภอหาดใหญ่ จังหวัดสงขลา โดยใช้คอมพิวเตอร์แบบระบบสัมผัส(touch screen) ชั้นบน จัดแสดงเกี่ยวกับประวัติความเป็นมาและพัฒนาการของโรงเรียนในเครือหาดใหญ่อำนวยวิทย์ และของมหาวิทยาลัยหาดใหญ่ ประวัติของมหาวิทยาลัยหาดใหญ่ หอนก เป็นศาลาเล็กๆ สำหรับไว้ปลูกไม้ดอก แขวนกรงนก หรือสำหรับใช้เป็นที่นั่งพักผ่อน ของคนภาคใต้ ใช้เป็นอาคารสำหรับต้อนรับผู้มาเยี่ยมเยือน หอเกียรติยศ (Hall of Fame) เป็นห้องแสดงถึงเกียรติยศและเกียรติภูมิของมหาวิทยาลัย , บุคคลสำคัญของมหาวิทยาลัยที่มีส่วนร่วมในการผลักดันให้ก่อเกิดสถาบันการศึกษา จนกระทั่งมีพัฒนาการที่เจริญก้าวหน้าเป็นที่รู้จักทั้งในและต่างประเทศ ประกอบด้วย ห้องจัดแสดงประวัติและผลงานบุคคลสำคัญมหาวิทยาลัยหาดใหญ่