ภายในพิพิธภัณฑ์แห่งนี้ ได้จัดแสดงอัญมณีและเครื่องประดับแบบครบวงจร โดยมีแนวคิดให้ผู้ที่มาเยี่ยมชมได้ศึกษา ตั้งแต่การกำเนิดของอัญมณี อันเป็นต้นธารไปจนถึงปลายธารที่อัญมณีได้อยู่คู่กับตัวเรือนโลหะมีค่า กลายเป็นเครื่องประดับที่สูงค่าในที่สุด มีการจัดแสดงแหล่งกำเนิดอัญมณี ประเภทต่างๆ การเจียระไน การจัดระดับมาตรฐานคุณภาพอัญมณี โลหะมีค่า กระบวนการผลิตเครื่องประดับ ทองคำ แพลทินัม และเงิน รวมทั้ง จัดแสดงอัญมณีสังเคราะห์ อัญมณีเลียนแบบ และแก้วผลึก การจัดแสดงนิทรรศถาวรของพิพิธภัณฑ์อัญมณีและเครื่องประดับ ประกอบด้วย โซน A : การกำเนิด และเหมืองพลอยในประเทศไทย โซน B : ประเภทอัญมณี โซน C : เพชร โซน D : การเจียระไนเพชร เจียระไนพลอย โซน E : อัญมณีอินทรีย์ โซน F : อัญมณีสังเคราะห์ โซน G : เหมืองทองและโลหะมีค่า โซน H : เครื่องประดับอัตลักษณ์ไทย และสื่อ Interactive ต่างๆ เพื่อเพิ่มมิติการเรียนรู้ด้านอัญมณีให้สนุกยิ่งขึ้น